| Наименование характеристики |
Значение характеристики |
Единица измерения характеристики |
Инструкция по заполнению характеристик в заявке |
| Покрытие генов при амплификации: HLA-DPA1, DQA1 - экзонов 1,2,3,4 – |
соответствие |
|
|
| Покрытие генов при амплификации: HLA-DRB4 - экзонов 2,3 – |
соответствие |
|
|
| Набор рассчитан на постановку реакций 96 – |
соответствие |
|
|
| Хранение и транспортировка наборов: при – 20 °С – |
соответствие |
|
|
| Максимальная вместимость образцов в проточные ячейки секвенатора MiSeq: Micro FlowCell (1,2 Gb), образцов 24 – |
соответствие |
|
|
| Максимальная вместимость образцов в проточные ячейки секвенатора MiSeq: Standard FlowCell (4,5 Gb), образцов – |
90 |
|
|
| Покрытие генов при амплификации: HLA-DPB1 - экзонов 1,2,3,4,5 – |
соответствие |
|
|
| совместимость с программным обеспечением NGSengine - |
наличие |
|
|
| Покрытие генов при амплификации: HLA-A, C - экзонов 1,2,3,4,5,6,7,8 – |
соответствие |
|
|
| Протокол отбора фрагментов по размеру использует методику очистки на магнитных частицах SPRI – |
соответствие |
|
|
| Набор предназначен для HLA-типирования в мультиплексном формате на высоком разрешении по 11 локусам HLA (A, B, C, DRB1, 3, 4, 5, DQB1, DPB1, DQA1, DPA1) с использованием метода «секвенирования нового поколения» (NGS) – |
соответствие |
|
|
| Анализ выполняется на различных платформах NGS-секвенаторов, таких как Illumina, Ion Torrent, Pacific Biosciences, ONT – |
соответствие |
|
|
| Анализ включает этапы HLA локус-специфической мультиплексной амплификации, приготовления библиотек (ферментная фрагментация, обработка концов, лигирование адаптеров, индексирование) и секвенирование, включающее в себя клональную амплификацию. Далее проводится обработка результатов секвенирования и интерпретация результатов HLA-типирования в специальном программном обеспечении NGSengine – |
соответствие |
|
|
| Максимальная вместимость образцов в проточные ячейки секвенатора MiSeq: Nano FlowCell (0,3Gb), образцов 6 – |
соответствие |
|
|
| Амплификационная часть набора включает: смесь для ПЦР с Taq-полимеразой для амплификации длинных фрагментов; смесь специфичных праймеров к генам HLA локусов; очищенная вода для ПЦР реакций – |
соответствие |
|
|
| Амплификационные смеси в целях оптимизации сигнала представлены тремя пробирками – |
соответствие |
|
|
| Смесь А включает праймеры к HLA-A, DRB1, DRB3, DQA1, DPB1 (экзон 1); Смесь В включает праймеры к HLA-В, DRB5, DQB1; Смесь С включает праймеры к HLA-C, DRB4, DPA1, DPB1(экзоны 2-5) – |
соответствие |
|
|
| Покрытие генов при амплификации: HLA-B - экзонов 1,2,3,4,5,6,7 – |
соответствие |
|
|
| Покрытие генов при амплификации: HLA-DRB1,3,5, DQB1 - экзонов 1,2,3,4,5,6 – |
соответствие |
|
|
| Библиотечная часть набора включает: Ферменты для фрагментации библиотеки; Буфер для фрагментации; Фермент для восстановления концов; Буфер для восстановления концов; Фермент для лигирования адаптеров; Энхансер для лигирования; ПЦР-смесь Hi-Fi; Адаптеры, специфичные к NGS-секвенатору; Индексы, совместимые с секвенатором, раскапанные в 96-луночные планшеты; Очищенная вода для ПЦР; Частицы SPRI; Буфер для элюции – |
соответствие |
|
|
Показать всё
Скрыть
|